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尊龙凯时-人生就是博:SomaScan与Olink的多维度数据对比解析

发布时间:2025-03-22   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在众多血液蛋白质组检测技术中,除了传统的质谱基础非靶向技术外,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组方法——SomaScan技术和Olink技术正受到研究者们的青睐。这两种技术已帮助科研人员生成了大量数据与有效信息,令这对「蛋白检测双子星」不断发展与迭代,已踏入激烈竞争阶段。目前,SomaScan已更新至11K,而Olink也达到了5K。然而,面对这两种技术,研究人员在选择时可能会感到困惑。为了帮助大家更好地理解这两大技术,本文整理了近年来关于这两种平台在检测稳定性、精确度、灵敏度及检测蛋白数量等方面的比较文献,以供参考。

尊龙凯时-人生就是博:SomaScan与Olink的多维度数据对比解析

第一篇研究

2023年的一项研究分析了48684名UK Biobank参与者的Olink蛋白质组学数据与35892名来自冰岛人群的SomaScan蛋白质组学数据,探讨了这些样本中蛋白质水平与基因型及表型信息之间的关系。同时,有1514名参与者在OlinkExplore3072和SomaScan5K两个平台上进行了检测,研究者对这两个平台的结果进行了深入的比较。研究结果表明,这两种流行的高通量蛋白质组学平台提供的信息具有重要价值,同时也显示出它们之间的差异,这些差异在某些情况下呈现出有益的互补性。尽管初次发布时对平台比较的分析存在错误,后续的勘误显示,Olink的CV值显著高于SomaScan,而SomaScan的精确度更高。

第二篇研究

2025年的一项研究比较了两种基于亲和力的蛋白质组学平台(Olink Explore 3072和SomaScan 11K)在4000名中国成年人中检测2168种血浆蛋白质的性能。主要结论包括:(1)两种平台测量的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),蛋白丰度和数据质量是影响相关性的主要因素。尤其是Olink平台中低于检测下限的样本比例较高,这是导致两个平台相关性低的关键。(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink和SomaScan分别鉴定出765种和513种具有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs)的蛋白,其中400种蛋白在两个平台间共定位。(3)Olink和SomaScan分别有1096种和1429种蛋白与体质指数(BMI)相关。(4)Olink和SomaScan各有279种和154种蛋白与缺血性心脏病(IHD)风险相关。(5)在加入传统IHD风险因素后,Olink和SomaScan的ROC AUC分别从0.845提升至0.862和0.863。这些结果展示了这两种平台的实用性,为未来研究的设计与解释提供了依据。

第三篇研究

2024年的一项研究对Atherosclerosis Risk in Communities(ARIC)研究中102名患者的血浆样本同时进行了SomaScan 11K和Olink Explore HT(5400+蛋白)检测对比。研究结论显示:(1)Olink中超过50%的蛋白在一半样本中未被检测到,而SomaScan的所有蛋白均在检测范围内,表明其灵敏度更高。(2)总体上,SomaScan的CV中值为68%,显著低于Olink HT的357%。随着产品迭代,SomaScan维持了良好的稳定性,而Olink在新加蛋白时则显示出较高的不稳定性。(3)在重复样本检测中,SomaScan的相关性更佳,相关性中位数为0.85,Olink为0.65。(4)SomaScan的cis-pQTL数量约为2800,Olink为2100。(5)通过对两个平台共有检测的超过4400个蛋白进行相关性分析,得出相关性r中位值为0.14。其中约三分之一的蛋白显示出良好的跨平台相关性。

第四篇研究

2025年进行的一项研究运用七种蛋白质组学平台(包括SomaScan 11K、7K、Olink 5K、3K、质谱-高丰度蛋白去除法和质谱-纳米磁珠富集法)对78名个体血浆进行了蛋白质组学检测及结果比较。主要结论包括:(1)七种技术平台共鉴定13007个Unique蛋白,其中SomaScan 11K和7K覆盖最多蛋白质,分别为9645个和6401个。(2)SomaScan平台的CV值最低,是最准确且稳定的技术平台,其11K和7K的CV中值分别为53%和58%;Olink 5K的CV中值超过Olink 3K的两倍多。(3)关于数据完整性,SomaScan平台在所有78个样本中的数据完整性最高,分别为96.2%和95.8%。Olink 3K的完整性为60.3%,而Olink 5K则降至35.9%。

综上所述,以上研究均显示SomaScan平台在检测蛋白数量与稳定性方面表现优异,是血液大队列研究的理想选择!在探索血液蛋白质组学的新纪元中,强烈推荐尊龙凯时-人生就是博的SomaScan P7K/P11K,助您突破检测限制,以精准的方式发现血液蛋白质标志物,实现临床转化的机遇,欢迎有兴趣的科研人员前来咨询。